Soutenance de thèse de Valentin Quèbre

07 mars 2022 par Patricia Siguier
Etude des complexes ADN/Protéines impliqués dans la ségrégation de l’ADN bactérien

Jeudi 24 Mars 2022

Valentin Quèbre présentera ses résultats sur l’étude des complexes ADN/Protéines impliqués dans la ségrégation de l’ADN bactérien.

 

 

Résumé :

La ségrégation des chromosomes et des plasmides à bas nombre de copies chez les bactéries est basée sur un mécanisme actif de positionnement. Il repose sur des systèmes de partition qui assurent la répartition intracellulaire des réplicons afin qu’ils soient transmis de façon fidèle à la descendance. Ils font intervenir trois partenaires encodés par la molécule à ségréger. Une protéine de liaison à l’ADN (ParB) s’assemble en un complexe de partition autour d’une séquence centromérique (parS). Une protéine NTPase, interagissant avec le complexe de partition, est responsable de l’activité de ségrégation et du positionnement du complexe de partition et ainsi du plasmide. Mon projet de thèse vise d’abord à approfondir le mécanisme d’assemblage du complexe de partition du système majoritaire de type I des plasmides F et pESBL et ensuite, à déchiffrer le mécanisme global de partition du système atypique de R388 récemment découvert, n’utilisant pas de NTPase codée par le plasmide pour assurer son positionnement.
Ainsi, mon projet s’articule en trois parties. (i) Comprendre par une approche mutationnelle le mécanisme d’initiation de l’auto assemblage de l’ensemble des ParB du plasmide F en un complexe de haut poids moléculaire dynamique, autour de parS. (ii) Identifier les partenaires du système de partition du plasmide pESBL, caractériser in vitro l’interaction de ParB avec parS et déterminer par une étude in silico, le groupe auquel il appartient. (iii) Identifier le rôle des différents domaines de la protéine de liaison à l’ADN StbA du plasmide R388 dans ses activités et caractériser les modalités d’interaction de StbA avec son site spécifique sur le plasmide, par des approches de séquençage à haut débit et de biochimie, pour comprendre l’architecture du complexe de partition.
Cette étude a permis d’approfondir nos connaissances sur la biologie des plasmides portant un système de partition de type I et a mis en lumière les spécificités d’interactions ADN/protéines d’un système atypique, ouvrant la voie à la compréhension de son mécanisme de stabilisation.

Equipe Gedy – Jean-Yves Bouet et François Cornet